提高政府效能、展現施政績效，向來是世界各國政府一直努力要達成的目標，衛生署積極配合行政院研究考核委員會推動之計畫管理制度，落實從計畫階段起即強調成本、結果導向及顧客導向的觀念。責成本署中醫藥委員會規劃「中程計畫推展中醫藥業務」之施政策略，挈領設定臺灣中醫藥發展之願景、目標及任務。該會以「整合與前瞻」作為施政理念，特擘劃「提昇中醫藥現代化與國際化發展方案」（如附件圖一）為施政架構，架構「建構中醫整體臨床教學體系CCMP2002-2008計畫」、「建構中藥用藥安全環境計畫」及「中醫藥現代化與國際化整合型計畫」等三項中程施政計畫，做為重要施政依據，有計畫地推動各項業務，其中「建構中藥用藥安全環境計畫」更於95年5月26日獲行政院院臺衛字第0950022766號函同意辦理。 近年來衛生署中醫藥委員會在上述架構基礎下，持續推動多項中醫藥重大管理措施：落實中醫臨床教學訓練，健全中醫師培育環境；辦理中醫醫事人員繼續教育計畫，維護中醫醫療照護品質；推動中藥材包裝標示及中藥新藥開發，全面提昇中醫藥產業水準，健全中藥臨床試驗環境，並推動中醫藥科技發展及國際衛生事務等，施政成果頗為豐碩。其中較受各界矚目及肯定者，如成立「中藥臨床試驗中心」，公告「臺灣傳統藥典」，傳統中藥廠全面實施GMP，以類似美國FDA標準審核通過、核發中藥新藥許可證乙件，公告「中醫醫療院所安全作業參考指引」，辦理中醫醫院暨醫院附設中醫部門評鑑、並據以公告33家中醫醫療機構負責醫師二年以上醫師訓練合格醫院，作為中醫師臨床教學訓練基地。 該會在成立12週年之際，辦理下列會慶系列活動： 1.「中藥用藥安全暨政策宣導研討會」：於96年9月30日（日）、96年10月28日、96年11月4日、96年11月18日、96年12月30日、97年1月20日分別假行政院衛生署苗栗醫院、嘉義市再耕園、台中縣弘光科技大學、高雄縣勞工育樂中心、臺北市立聯合醫院中醫院區、花蓮縣衛生局辦理六場次研討會。 2.「2007年中醫藥英文研習班（English Course in Traditional Chinese Medicine）」：本研習班自96年11月3日起續8週，每週六假中國醫藥大學授課。 3.「兩岸中醫護理學術研討會」：將於96年11月8日假林口長庚醫院舉辦。 4.「95年度中醫藥研究成果發表會」：將於96年11月17日至18日假嘉南藥理科技大學舉辦。 5.「傳統醫學與現代醫學在泌尿疾病的對話研討會」：將於11月24日假臺大醫院國際會議中心舉辦。 6.「第14屆國際東洋醫學會」：將於96年12月2日至4日假台大醫院國際會議中心舉辦。 該會表示：希望藉由此一系列活動，讓從事中醫藥研究之相關人士，進行學術交流，瞭解國際脈動，進而與國際接軌，並提供國內外產、官、學、研於會中進行良好互動，以增進彼此間之合作關係。加速中醫藥之現代化與科學化，並保障國人之健康及用藥安全，使我國在國際間更具有競爭之優勢。