台灣中藥材近九成來自境外輸入，加上國人藥食同源的觀念與藥膳食補盛行，政府做好中藥材品質管制，才能讓消費者用的安心。為確，收錄常用中藥材300項，建立中藥材之基源品質等標準及鑑定方式，以保國人使用中藥的品質與安全，衛生福利部101年底公告臺灣中藥典第二版科學方式來管理中藥材。並自101年8月1日起實施中藥材邊境管理制度，將紅棗、黃耆、當歸、甘草、地黃、川芎、茯苓、白芍、白朮及杜仲等10項進口量大之中藥材，列屬應實施進口檢驗項目，即在邊境進口時，要求業者檢附合格檢驗證明文件，證明所申請進口的中藥材，符合我國安全標準；其中紅棗、黃耆、當歸及甘草等4項國人最常用的中藥材，除應檢附檢驗證明外，在海關還需進行邊境抽批查驗，以阻隔不合格中藥材於境外，保障民眾用藥安全。
至103年5月31日止，共受理4,304件中藥材報驗通關案，總計2萬1,297公噸，其檢附之檢驗證明文件，均符合我國限量標準。至於應實施抽批查驗之紅棗、黃耆、當歸及甘草，其中2批自大陸進口之黃耆（5,290公斤）因總重金屬含量超出限量，判定不合格，全數依規定予以退運或銷毀。
經由上述管制措施，將更能確保輸入之中藥材符合我國規範，使民眾用藥更為安全，更有保障。衛生福利部也呼籲民眾，勿購買來路不明之中藥材，使用中藥材之前，應經適當清洗程序，以減少栽種或儲存過程所殘留異常物質。同時，本部也將持續監控進口與市面販售之中藥材，加強風險管控，阻絕不良品於市面流通，以確保中藥使用的安全。