根據醫學人類學的研究指出：傳統醫學是構建整體文化體系最重要的一部分組成元素，傳統醫學之概念可引導文化中的個體利用其認為最合理、最易接受的方式來維持自己身體的健康。世界衛生組織(WHO)在第55屆世界衛生大會（2002年5月26日）首度發表長達80頁之劃時代專業報告「2002-2005年傳統醫藥全球策略」，建請各國政府將傳統醫學發展納入現有醫療政策，並設立專責機構辦理。目前，歐美與亞洲各國都非常重視與積極發展傳統醫學，傳統醫藥是各民族的重要寶藏，亦是我國傳統瑰寶，臺灣洞悉此一趨勢，早於1995年11月1日正式成立傳統醫學專責單位-「衛生署中醫藥委員會」，掌理全國中醫、中藥業務之推展，更助益了台灣中醫藥體系的蓬勃發展。
該會成立13年以來，在歷任主任委員規劃「中程計畫推展中醫藥業務」之施政策略下，挈領設定臺灣中醫藥發展之願景、目標及任務，以「整合與前瞻」作為施政理念，特擘劃「提昇中醫藥現代化與國際化發展方案」之施政架構，架構「建構中醫整體臨床教學體系CCMP2002-2008計畫」、「建構中藥用藥安全環境計畫」及「中醫藥現代化與國際化整合型計畫」等三項中程施政計畫，做為重要施政措施，有計畫地推動各項業務，包括：落實中醫臨床教學訓練，健全中醫師培育環境；辦理中醫醫事人員繼續教育計畫，提升中醫醫療照護品質；推動中藥材包裝標示及中藥新藥開發，全面提昇中醫藥產業水準，健全中藥臨床試驗環境，並推動中醫藥科技發展及國際衛生事務等，施政成果頗為豐碩，深受國際間矚目、認同。
其中較受各界肯定者，如：成立15家中藥臨床試驗中心，公告「臺灣傳統藥典」，中藥廠全面實施GMP，以類似美國FDA標準審核通過、核發中藥新藥許可證乙件，公告212種可同時提供食品使用中藥材、「中藥新藥臨床試驗基準」；推動中藥材全面包裝標示，發布324種應包裝標示之中藥材飲片品項；加強有害物質管制，中藥材與製劑分別訂定重金屬、污穢物質及黃麴毒素等各種限量標準；辦理中醫醫院暨醫院附設中醫部門評鑑，公告44家中醫醫療機構負責醫師二年以上醫師訓練合格醫院名單；委託研究計畫成果取得中華民國專利6項、美國專利1項、技術移轉2項，出版209項出版品；積極參與國際衛生組織，成功舉辦第12屆、14屆國際東洋醫學學術大會。
除上述計畫外，未來，將持續透過推動「建構中藥用藥安全環境第2期計畫（2010-2014）」、「中醫醫療機構負責醫師訓練計畫」、「中草藥奈米計畫(98-103)」、「中醫藥典籍數位典藏及數位學習計畫（99-104）」等計畫，培育全人中醫，促進中醫醫療機構健全發展；建立源頭管理機制，把關藥材品質；發展中西醫合作研究與醫療模式，達成科技厚生之全民價值，具體落實總統政見，加速中醫藥之科學化與現代化，回應民眾殷切的期盼，讓民眾安全健康更有保障。