衛生署疾病管制局表示，本（2011-2012）流感季流感疫苗在今（100）年10月1日開打後，65歲以上長者等民眾接種情形踴躍，接種率均較去(99)年明顯增加，惟6歲以下幼兒接種率僅小幅度成長，該局憂心家長對於疫苗安全的疑慮或工作忙碌而延遲接種，恐危害幼兒健康，特別籲請家長應及早帶家中幼兒接種流感疫苗，為流感季來臨前做好準備。
疾管局表示，根據各合約院所回報資料顯示，疫苗開打10日以來，疫苗接種量已突破74萬劑，較去年同期增加近10萬劑之多，同時據各地方衛生單位反映，本年度民眾接種意願普遍提升，國小學童家長同意接種比例亦較去年為佳，唯獨6歲以下幼兒家長似乎仍有遲疑，截至10月10日止，6個月以上至入學前幼兒之流感疫苗接種率僅達5.7％，相較於去年同期的4.6％，接種意願稍回升，但由於未滿9歲首次接種流感疫苗之幼兒需接種2劑，為能於流感季（11月）來臨前獲得足夠保護力，目前接種比例仍屬偏低。
疾管局指出，於上ㄧ（2010-2011）流行季，6歲以下幼兒罹患流感之比例居所有年齡層之冠，罹患後產生併發症機率為一般人的4倍，併發症死亡機率又為一般人的7倍，因此流感對於幼兒的健康威脅不容小?，而接種疫苗是預防流感最有效的方法，今年元月國際知名疫苗醫學期刊Vaccine刊登一篇在日本所進行的研究，發現完整施打流感疫苗可降低該些嬰幼兒因流感引起的住院率達7成，對於抵抗力最差的6至12個月嬰兒之預防感染流感的效果也有8成，顯示嬰幼兒接種流感疫苗的效益顯著。另今年8月底美國國家學會醫學研究部發表的研究報告，顯示流感疫苗是安全的。
疾管局指出，家中成年人、就學之學齡前及學齡兒童，是將流感病毒帶回家傳染給嬰幼兒之主要傳播者，而嬰兒罹病後往往症狀較嚴重，因此為使孩童於流感季獲得足夠保護力，該局呼籲家中有幼兒的家長，應把握優先接種權利，儘快攜帶幼兒前往接種，俾能及時預防流感的侵襲。