食品藥物管理署歷年來致力於推動藥品國際合作，除了持續加強與歐、美、日等國雙邊高層官員互訪，建構合作平台，蒐集法規資訊並協助業者因應，更積極參與國際組織及會議，如國際藥品法規協和會議暨相關技術性會議（ICH）、亞太經合會（APEC）、藥物資訊協會（DIA）、世界藥學會（FIP）及國際學名藥法規主管機關會議（IGDRP）等，以瞭解各國藥政法規協和化過程，藉此平台與歐、美、日等國交換藥政管理經驗，以促進我國藥物法規與國際接軌，深化雙邊及多邊的藥物經貿合作關係。
綜觀102年度，可說是我國推動藥品國際合作重要的一年，經食品藥物管理署的積極努力，我國除在亞洲領先中、日、韓成為國際醫藥品稽查協約組織（PIC/S）第43個成員國外，並經多年協商，終於102年11月與日本簽署「藥物法規合作框架協議」，為促進台日藥物合作，奠定穩固的基礎；在歐洲方面，我國於8月正式提出申請加入歐洲藥典觀察員（European Pharmacopoeia observer）後，透過歐盟衛生暨消費者保護總署（DG SANCO）的大力支持，於12月2日接獲通知正式成為歐洲藥典觀察員。此外，亦爭取到主辦多場國際會議，包括首次在台舉辦之世界藥學會（FIP）銜接性試驗研討會、亞太經合會（APEC）罕藥研討會、新型流感疫苗研討會等國際會議，及第1屆台日醫藥交流會議，就新藥及學名藥審查、GCP及GMP查核等多項議題達成共識，同步推動台日合作事宜及簽訂協議。這些重要的合作事項，為我國歷年來積極推動國際合作之努力成果，亦代表國內製藥技術與品質獲得國際肯定，對於提升醫藥產業國際競爭力，奠定重要里程碑。
展望未來，103年將拓展及持續深耕102年之合作成果，促進我國與國際間的交流互動，提升台灣的國際能見度；我國亦爭取到主辦第30屆國際藥物流行病學與治療風險管理會議（ICPE）及2014年國際學名藥法規主管機關會議（IGDRP），並一併辦理學名藥產業國際會議，加強我國與已簽署MOU或MRA的國家交流合作，不僅能提升我國學名藥品質與法規管理的國際影響力，並期能藉由相關產業國際會議與交流，展現我國學名藥產業的技術實力。