為確保端午節食用粽子衛生安全，衛生署自5月起即督導各縣市衛生局加強抽驗，總計稽查業者粽子製程衛生1396家次，全符合食品良好衛生規範；抽驗9種粽子材料共562件，結果498件(88.6%)合格、64件不合格，不合格食材集中於粽葉（6/144，4.2％）及蝦米（31/150，20.7％）二氧化硫過量，蘿蔔乾（27/89，30.4％）則為苯甲酸防腐劑過量。
此外，台北市及雲林縣衛生局各還查獲1件鹼粽添加硼砂，台南縣查獲4件粽子添加防腐劑己二烯酸或苯甲酸，台中縣查獲1件粽子添加防腐劑己二烯酸。各衛生局除依據食品衛生管理法處辦，要求販售業者不得繼續陳售，並同步追蹤製造源頭；一旦查獲，將依據違反食品添加物使用範圍及用量標準之規定，處製造業者新臺幣3萬元至15萬元罰鍰。
衛生署呼籲，消費者購買粽子時，販售場所環境衛生是首要考量，其次要注意檢視產品外觀，粽子外表不可有破損或內容物外漏，如果發現內部黏稠成絲狀，請民眾不要購買或食入，因為這是粽子即將腐敗之前兆，如貿然食用可能會產生食品中毒。
由於蝦米經乾燥置於常溫保存，褐變乃必然之事，為防止褐變，業者常會添加二氧化硫保色。衛生署建議民眾購買蝦米時，宜選購形體完整、碎屑少的產品較佳，外觀有不正常紅色或色澤太紅的產品，可能添加色素或二氧化硫殘留超量。台灣氣候潮濕，散裝蝦米容易發霉腐敗，在選購時一定要注意蝦米的色澤及氣味，若沒有蝦的香味或是有霉味，千萬不要購買。
至於蘿蔔乾防腐劑過量比率仍高，衛生署分析，現代人主張少鹽多健康，但是低鹽度的蘿蔔乾不耐儲存，很容易發霉腐壞，除非低溫冷藏，否則添加適量之食品添加物於室溫販售乃屬必然，但也經常造成防腐劑苯甲酸鈉超過規定用量。衛生署特別呼籲，商家若不慎購入雲林縣業者李友通製造之「黑心菜脯」，必須儘速下架並與衛生單位聯繫；也建議民眾購買冷藏菜脯，切勿購買來路不明、過白及有甲醛嗆味之產品，以確保飲食安全。
對於過量之食品添加物，均可藉浸泡一小時以上而後充分的洗滌加熱，予以去除大部分的殘留及破壞，達到安全食用之目的。