缺血性腦中風是目前台灣地區最常見的腦中風型態，健保局自93年1月1日起即給付急性缺血性腦中風發病三小時內使用合成的血栓溶解藥（r-TPA,如ActilyseR），增加中風病人康復的機會或降低殘障等級。經查，98年至100年診斷為腦中風的病人中，醫療院所申報使用r-TPA藥品的人數，由724人增加至1,263人，有逐年升高之趨勢。有關101年6月18日媒體報導台灣腦中風學會指稱，注射腦中風藥物r-TPA不是手術，健保沒給付，係屬錯誤訊息。
對於急性缺血性腦中風的病人，若能儘早診斷、儘速使用r-TPA(發病3個小時內)是得到好的治療結果重要因素，因此提升各級醫院的急診品質是對於這類病患照顧的重要策略。
健保局於99年1月1日起即調增檢傷分類之急診診察費支付標準，並將夜間急診診察費用加成率由2成提高為5成。並於101年5月1日公告實施的「全民健康保險急診品質提升方案」中，納入急性腦中風之急診病人，在符合健保用藥規定之3個小時內診斷及完成r-TPA注射之個案給予獎勵，每個個案可以申報2,000點的獎勵，以確保病患在用藥安全的前提下，得到適當、有效的醫療照護及品質。
對於腦中風病人或其他病疾病患住院治療時，按病床類別(加護病房或一般病房)，每天支付住院診察費由712點至257點不等，如需要會診其他專科醫師，則支付住院會診費，而且腦中風病患住院治療期間接受本保險給付範圍內之病床費、檢驗(查)、處置、手術或藥物治療，健保均有給付，並無文內提及「治療中風沒有健保給付，頂多會診費及中風給付與治療粉刺給付費用相同」之情事。