芊鑫實業社非法使用二甲基黃事件，食品藥物管理署及各縣市衛生局持續追查下游產品流向及下架情形，依據各縣市衛生局回報結果，截至103年12月17日上午10時止，總計出動54人次，稽查155家次（販售商/經銷商24家次、大賣場/超市/便利商店117家次、食品製造加工業者14家次），有使用二甲基黃之問題產品已下架、回收2311公斤，詳細問題產品清單如附件1，另台南市政府衛生局回報芊鑫實業社下游業者更新為12家，流向圖如附件2。
食藥署檢驗案內產品，在稽查送驗檢出為陽性的檢體中，豆乾成品之含量範圍為2.1 ~ 63.6 ppb (parts per billion表示十億分率)。二甲基黃非我國準用之色素，雖有研究顯示二甲基黃可能令實驗動物罹癌，惟未有足夠證據指出從膳食中攝入該染色料對人類健康的影響。
依據103年12月10日總統令公布修訂之食品安全衛生管理法第15條第1項第10款規定，食品添加未經中央主管機關許可之添加物情形，不得製造、販賣、公開陳列，違者依同法第44條處6萬-2億元罰緩，另依同法第49條可處7年以下有期徒刑，併科8000萬元以下罰金。食品藥物管理署再次呼籲豆製品業者使用消泡劑，若使用到「芊鑫豆製品乳化劑」，應立即停止使用並退回原購買廠商，並應於103年12月17日24時前向轄區衛生局自主通報製成產品品名、規格、批號與有效日期、數量，並於12月20日前辦理自主回收、下架作業。倘再查獲使用違規食品添加物製造相關產品，將祭以重罰。
新修正之食品安全衛生管理法要求所有食品業者全面登錄，食品添加物之製造、輸入業者應於103年5月1完成登錄，因此本署能即時有效掌握業者及產品資訊。本次違法添加二甲基黃之豆乾事件，藉由登錄系統所建構的資訊，具有「快、準、易查」優勢，讓本署立即掌握事件資訊，並對相關原料追溯抽驗，始能發現源頭之不法添加行為。此外，新法亦要求食品添加物業者應於104年2月5日登錄追溯追蹤系統，建立產品原材料、半成品及成品供應來源及流向資訊，將更進一步強化管理及因應未來食安事件的發生。