食品藥物管理署（以下簡稱食藥署）說明，食品中所含之微量塑化劑，多因食品原料遭受環境污染，或於食品生產、加工及貯存過程中，透過塑膠材質設備、容器或包材等之游離溶出，間接污染食品，與經人為惡意添加而檢出高量之塑化劑情況不同，故該種污染物質之管理，應以預防等源頭管理為主。國際間對於塑化劑之管制標準均訂於塑膠容器包裝之溶出限量，該署亦依國際管理原則，於食品器具容器包裝衛生標準中訂定鄰苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP等六種塑化劑之溶出限量，另規定專供3歲以下嬰幼兒使用之食品器具及容器，不得添加鄰苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)、鄰苯二甲酸二正辛酯(DNOP)、鄰苯二甲酸二丁酯(DBP)及鄰苯二甲酸丁苯甲酯(BBP)等4種塑化劑。整體而言，相關規定仍較先進國家更為嚴格。
另外，為強化業者自主管理，自源頭減少塑化劑污染食品之風險，食藥署亦已訂有「降低食品中塑化劑含量之企業指引」，供業者自訂預防或改善產品受塑化劑污染之品質管理工作時，可參考之監測指標及行動準則。該指引除提供食品中含塑化劑之監測指標值外，針對檢出塑化劑含量超過監測指標值，應進行風險評估，以及後續異常處理措施等，均訂有明確之行政指導，可作為企業自主品管之依據，以落實食品企業自主管理之精神，確保食品安全、兼顧產業發展。
經歷食品塑化劑事件後，中央及地方衛生機關針對市售高風險產品亦進行監測及調查，超過企業指引監測指標值之產品，均持續抽驗追蹤及輔導改善。食藥署強調，目前並無國家訂有食品中塑化劑之限量標準，由於塑化劑非准用於食品之化學物質，且可能於正常情況下微量遷移至食品中，故源頭管制塑膠材質是否符合標準，始為減少暴露塑化劑之道。