有關媒體報導疾管署研檢中心吳和生主任論文發表疑義，疾管署說明如下：
一、 疾管署針對本案，已於本(2014)年5月進行相關調查，並訪談9位同仁，皆表示論文內未被要求由當事人擔任通訊作者，亦無以計畫主持人身分要求分配研究資源，或施壓同仁配合其發表論文，或有同仁不配合遭當事人要脅憤而轉調其他單位，皆與報導事實不符。
二、 據當事人表示，除擔任疾管署研檢中心行政主管外，亦同時擔任國家流感中心主任及腸道腹瀉實驗室負責人，並實際參與流感、腸病毒及腹瀉病毒等相關研究。經初步統計，八年期間共發表18篇擔任通訊作者之論文，其中9篇與流感病毒相關，5篇與腸病毒相關，3篇與諾羅病毒相關，另1篇則與細菌相關，係因2007年該實驗室負責人退休，故由當事人暫代，並於主持「病原性大腸桿菌快速系統之建立」計畫期間發表之論文，其後該實驗室另覓他人接任負責任後，當事人即未曾在疾管署細菌相關領域發表論文中擔任通訊作者。因此以上18篇論文之發表皆與其他實驗室負責人做法一致，並無不妥。
三、 依疾管署規定，同仁所發表之學術論文，必須依實際參與程度及簽辦長官核定，且經所有共同作者簽名確認與相關組室同意後才可投稿，因此過程可說相當嚴謹。另外48篇因參與前述相關實驗室之督導，對於論文也有研讀修改，所以於論文中共同具名發表。
有關此事件，疾管署新任郭署長表示，本案雖屬舊案，但為求萬全，將交由政風體系確認。