我國公費醫師培育制度始自民國64年，實施40餘年來共培育6,557名公費醫師，近5年分發至偏遠、離島地區之衛生所、本部醫院、支援山地巡迴醫療之教會醫院等機構服務之公費醫師共計399名，對於充實偏鄉地區之醫療人力具有重要貢獻。為使公費醫師培育制度更趨完善，衛生福利部於近期展開多項改革措施，期望使公費醫師能安心服務，投身偏遠地區提供民眾所需之醫療服務。
衛生福利部表示，公費醫師為國家重點栽培人才，對於每一位公費醫師之意見均非常重視，為使該制度更為健全，遂於105年12月邀請各界專家學者包括公費醫師代表，成立「公費醫師培育制度督導小組」，負責監督及改善公費醫師各項事務，如：
- 106年度擴大分發服務機構及醫院之缺額數，增加公費醫師選擇服務醫院之自由度。
- 研議修正轉分發服務醫院流程，使公費醫師可依其個人意願逕向衛福部提出轉院申請。
- 規劃於今（106）年度進行醫院缺額需求調查時，將同時要求提供薪資待遇、福利項目等內容，作為公費醫師選擇之參考，並落實保障公費醫師之福利待遇。
- 分發後醫院對於公費醫師如有不平等對待之情事，情節重大者，將不再分發公費醫師至該醫院。至於，公費醫師於服務階段如有任何問題，皆可向衛福部醫事司或醫福會(主管部立醫院)提出申訴。
對於105年辦理之新制公費醫學生，衛福部已經召開了2次座談會，與各校公費醫學生逐條就契約內容進行討論並獲共識，未來相關規範與制度之建立，亦將邀請學生代表參與，且將定期舉辦座談會，透過良好的溝通管道，減少公費生對於未來生涯的擔憂。
衛生福利部重申，公費醫師制度為國家重要政策，將與公費醫師攜手，共同打造完善的制度藍圖，讓公費醫師能安心貢獻偏鄉醫療，照顧最有需要的民眾，讓習醫的初衷，持續發光發熱。