行政院長毛治國今（20）日出席「104年全國登革熱研討會」開幕致詞時表示，登革熱防治必須成為年度性常態防禦工作，臺灣受氣候變遷影響，大規模流行風險增高，我們應料敵從寬，中央與地方每年必須及早完成整備並展開預防工作，以梅雨季為關鍵時間點，在梅雨季之前完成整備工作。
毛院長指出，我們必須成立一套登革熱防疫新系統，並應律定新標準作業程序，一旦病情蔓延，採用專業方法因應，希望大家汲取今年的經驗與教訓，檢討過去、策勵將來。
毛院長強調，未來需持續推動的工作，首先是控制高雄疫情，其次要傳承經驗、記取教訓，請環保署注意孳清部分與加強落實程度，目前在臺南採取「切割加圍堵」策略，採用環境用化學藥劑，潛在孳生源也鋪設紗網，另外，也請衛福部檢討病患分流、醫療院所分工。目前相關部會已與學校合作展開長期研究性工作，探討流行病學與疫苗。有關國際經驗交流，12月7日將舉辦國際研討會，今日研討會由衛福部及環保署邀請專家召開，討論成果將作為與國外專家學者進一步討論的重要基礎。
毛院長指出，受氣候變遷影響，今年全球熱帶與亞熱帶的國家登革熱病例較往年有倍數增加情形，臺灣今年經歷多年以來最嚴峻的本土登革熱疫情，加上今年同時流行第一型、第二型不同型別登革熱病毒，整體疫情較為複雜，防疫難度特別高。登革熱是第二類環境性傳染病，但是9月上旬疫情快速攀升，超過地方政府防疫量能所能負荷。因此行政院依「傳染病防治法」規定，9月15日成立「登革熱中央流行疫情指揮中心」，協助地方政府加強孳生源清除、病例監測、病患就醫分流等工作。
毛院長表示，指揮中心成立後，在指揮官張善政副院長的領導下，帶領中央與地方共同努力，使原本最嚴峻疫區的臺南市，在中央規劃的大面積環境孳清後，次週疫情出現反轉現象。過去這段期間，在中央與地方齊心努力，共同達成讓臺南市登革熱疫情反轉的目標，是相當寶貴的經驗。毛院長並感謝張善政副院長、中央相關部會、地方政府、國軍與所有防疫人員的辛勞。
毛院長談及，今年登革熱疫情，自5月1日至9月15日臺灣各地有疫情出現，自累積病例分布與研判，臺南市與高雄市是本土病媒源頭，他縣市病例是病患流動，並非病媒蚊擴散。
毛院長指出，指揮中心成立時已注意相關難題，首先是病患確認的瓶頸，因為快篩劑尚未普遍使用，確認耗時；其次是病患住處消毒瓶頸，包括噴藥設備不足，病患住家戶內與戶外噴藥需求大排長龍，持續累積長達兩週以上，病媒蚊不斷重複傳染機率很高。此外，有關大範圍戶外孳清，因設備與動員能量均不足，病例擴散難以控制，加上地區醫療院所未予分工，病患過度集中部分院所，增加病患照顧風險。
毛院長指出，在提出對策方面，首先是立即下單增購噴藥設備，其次是透過執行孳清計劃，以達正本清源的效果。孳清計劃分成兩部分，其一是大面積環境孳清，採取「開防火巷」（熱區切割）方式，源自環保署長魏國彥提出面積平方假說，若採取防火巷，傳染力減半。後來發動帶狀環境清理，清理後，針對潛在孳生源使用正規用藥，加上覆蓋紗網，以保存戰果。另一是病患住家戶內／戶外的小範圍孳清，俗稱「打地鼠」（圍堵消毒）方式，隨出現隨清理，避免發生排隊現象，以控制疫情。另外，臺南市政府配合以里為單位，動員人力，執行孳清計劃，國軍也從旁大力協助。病患實施快篩分流，醫療院所則功能分工。
毛院長強調，有關防疫作為實施成果，9月15日中央成立指揮中心，自9月23日連續五週，發動五波大規模孳清，首波孳清隔週後，每日病例數從最高峰700餘件反轉，至10月底已壓低至100件以下，11月後更降至30件左右，因此11月18日指揮中心決議，臺南市部分工作暫告一段落。今年後續的工作，將以高雄疫區為重點，協助控制疫情。
毛院長表示，104年罹患登革熱不幸死亡案例中，60歲以上病患高達約90%；且95.5%均為有慢性病史者，應屬老年病患者，自體免疫能力較差。我們需探討此現象在流行病學與防疫工作上的意涵，以做好高齡人口的防疫工作，降低死亡率，並探討少數年輕患者感染與死亡原因。另外，也要探討感染數、住院數及加護病房（ICU）進住數之間的關係，以及ICU進住數與死亡數的關係。