鑒於近期國內食品或藥品常有混攙非法或非對應等級之原料來源，食品藥物管理署（以下稱食藥署）為確保國內健康食品之品質及安全性，於104年5月間聯合7縣市政府衛生局啟動「104年健康食品工廠稽查專案」，針對14家健康食品工廠之「健康食品原料來源及驗收」、「健康食品工廠良好作業規範與食品良好衛生規範」、「健康食品查驗登記符合性」及「健康食品包裝標示符合性」等項目加強查核。
食藥署聯合各縣市政府衛生局共出動40人次，完成14家健康食品工廠之查核；稽查結果中，2家已未從事健康食品製造，餘12家業者之原料來源尚符合食安法相關規定。其中5家業者之健康食品工廠良好作業規範與食品良好衛生規範，部分因測量儀器未定期校正、廠內物品未明確標示區隔等原因，所轄衛生局已命限期改正且經複查皆已合格。另抽查產品之原料投料、保健功效成分含量及產品包裝標示，均與查驗登記資料相符，查核結果如附件。
食藥署呼籲業者應落實自主管理，並依追溯管理原則，做好原料來源管控；於採購過程中，應建立完善之採購評選制度，並落實原料驗收管理，以維護食品衛生安全及品質。