疾病管制署表示，現為日本腦炎流行季節，提醒民眾做好個人防蚊措施；家中如有未完成日本腦炎疫苗接種之適齡嬰幼兒，請儘速帶往轄區衛生所或指定醫療機構完成接種；如住家或工作場所鄰近豬舍或水田等高風險環境且自覺有感染風險者，也可自費接種疫苗。
臺灣每年5至10月為日本腦炎流行季節，病例高峰通常出現在6至7月。國內今（2015）年截至6月8日尚無日本腦炎確診病例；2010年至2014年日本腦炎確定病例數分別為33、22、32、16及18例。各年齡層均有感染風險，以30到59歲風險為高，監測資料顯示確診病例數以中南部縣市較多。
依據世界衛生組織（WHO）資料顯示，日本腦炎病例好發於亞洲及太平洋地區等20多個國家，每年約通報68,000例病例；溫帶地區疫情發生於夏至秋季，副熱帶及熱帶地區則常年流行，多於雨季達疫情高峰。2014年全球累計通報病例數以印度、尼泊爾及中國大陸為最多，其次為越南、孟加拉及菲律賓等國。依據中國大陸衛生單位統計，今年截至4月累計通報25例，較去年同期（74例）少，疫情有逐年下降的趨勢。其他鄰近國家及地區中，越南自今年年初迄今，累計5名兒童死於日本腦炎；泰國今年截至5月初，累計通報3例，低於去年同期累計數（6例）；澳洲維多利亞州於今年1月通報自印尼峇里島境外移入之日本腦炎病例。另日本、韓國、香港、澳門等地今年尚未有通報病例。
日本腦炎病媒蚊主要孳生於水稻田、池塘及灌溉溝渠等處，吸血高峰為黃昏與黎明時段，而豬為病毒的主要增幅宿主，請民眾儘量避免於病媒蚊吸血高峰時段，在豬舍、其他動物畜舍或病媒蚊孳生地點等高風險環境附近活動；如果無法避免，應穿著淺色長袖衣褲，並於身體裸露處使用衛生福利部核可的防蚊藥劑，避免被病媒蚊叮咬而感染。相關疑問可至疾管署全球資訊網（http://www.cdc.gov.tw）或撥打免付費防疫專線1922（或0800-001922）洽詢。