疾管署已於2015年3月8日開放新版「傳染病統計資料查詢系統」（http://nidss.cdc.gov.tw/），提供70種傳染疾病之流行趨勢、統計圖表、地理分布，並即時揭露流行季重要傳染病波動情形（如流感、腹瀉、腸病毒、登革熱）及病毒型別資訊。民眾、學術界與媒體可透過視覺化查詢方式，快速掌握疫情資訊及趨勢。
　　為致力傳染病疫情公開及透明化，即時將疫情資訊及趨勢提供有需求民眾，疾管署更進一步將統計數據資料，採資訊產業界慣用的開放格式，及便於統計分析的EXCEL報表格式提供下載，並經由主動開放及便捷的操作方式，以強化產官學數據加值應用及跨域協同合作。
　　此外，疾管署配合台灣Open Data深化應用元年，於國家發展委員會「政府資料開放平臺」（http://data.gov.tw/taxonomy/term/513），開放了148個資料集，近70種個別傳染病統計資料、國際疫情及國際旅遊疫情等級建議，截至目前總計瀏覽29,005次，下載5,196次，未來將持續提供傳染病相關資料集。
　　疾管署歡迎民眾及產官學界將該署傳染病資訊充分運用，無論民眾監督、學界研究或產業加值都樂見歡迎，對抗傳染病的態度，應是疫情透明，不分地域，不分你我，全民攜手，才能達成快速防疫的目標。