衛生福利部食品藥物管理署(簡稱食藥署)公布103年邊境通關查驗約計61萬6,286批食品及相關產品，抽樣檢驗48,704批，抽驗比率7.90%，其中檢驗不符合規定663批，佔抽樣檢驗批數之1.36%(詳如表一)，主要不符合之產品類別為農產品類(生鮮冷藏冷凍蔬菜及水果、茶類)及加工產品類(調製蔬果及其他調製食品)，其主要不符合原因為農藥殘留、食品添加物不符合規定(詳如表二)，後續並依食品安全衛生管理法規定辦理。
依據食品安全衛生管理法第30條，輸入經衛生福利部公告的食品、食品添加物、食品器具、食品容器，應向食藥署申請查驗並申報產品有關資訊。又第52條，輸入產品經通關查驗不符合規定，除管制輸入外，並得公布商號、地址、商品名稱及違法情節。
針對邊境通關查驗不符合的食品，均應依規定辦理退運或銷毀，同時，食藥署會依照食品及相關產品輸入查驗辦法規定，提高產品的抽驗機率，最高可提高至100%抽驗；並同時責令食品業者實施自主管理，確保食品衛生安全。