菸品健康福利捐自今（98）年6月1日起調漲為20元，並採用繳交20元捐費的菸品應印製或黏貼辨識標記方式。採用辨識標記方式，除了可讓消費者能清楚辨識外，並因為有清楚的標記，能防止業者囤積菸品；預估今年6月1日實施時，超過8成的菸品均已由業者自行印製足以供消費者辨識的標記，政府需印製標記供業者黏貼的數量已相當少，所需的費用也少於1000萬元，黏貼標記的過渡期間也將不會太長。
以95年菸品健康福利捐由5元調漲為10元為例，如採補繳菸捐方式，因尚未販售菸品數量不易清查等因素，將可能發生補繳比例落差、納稅義務人不明確、易致菸品囤積等問題，且需進一步修法通過後，方能依法行政。衛生署重申，採標記方式以保護消費權益與防止業者囤積菸品。