今(100)年4月27日12時17分，嘉義阿里山地區發生小火車翻覆意外事故後，區域緊急醫療應變中心(REOC)即啟動緊急醫療系統展開大量傷患醫療救護。當日12時50分即已動員8名醫師、14名護理人員，搭乘直升機趕赴事故現場，展開現場之緊急醫療與後送工作，並出動消防單位及民間救護車、國防部海鷗直升機及內政部空勤總隊直升機，於3個半小時內將108位傷患分送六家急救責任醫院，展現良好之緊急醫療機制。截至今日(4月30日)止，尚有56人住院(11人於加護病房住院治療)。
衛生署南區區域緊急醫療應變中心(REOC)於當日中午12時25分主動收聽鄧事故無線電通訊後，立即通報衛生署及嘉義縣衛生局，啟動緊急醫療救護系統，並由衛生署空中轉診審核中心協調內政部空中勤務總隊及國防部海鷗部隊派遣直升機，於第一時間，即在嘉義縣衛生局的協助指揮下，將聖馬爾定醫院、大林慈濟等醫院之8名醫師與14名護理人員送達事故現場，設立臨時救護站，展開現場醫療救護處置，迅速依傷患受傷情形給予必要的醫療及後送等，整體救護工作計出動了直升機空中救護24架次、52部救護車，於當日16時40分己全員救出現場傷患，分送嘉義基督教醫院、嘉義長庚紀念醫院、佛教慈濟綜合醫院大林分院、行政院衛生署嘉義醫院、天主教聖馬爾定醫院等6家急救責任醫院，進行醫療救治。此次事故之相關醫療救護作為與努力獲得傷患及家屬的讚揚。
衛生署空中轉診審核中心係二十四小時均派有主治醫師進駐消防署救災救護指揮中心及國家搜救指揮中心，平時協助離島偏遠地區急重症傷病患緊急空中醫療轉送，自91年10月1日成立，8年中共空中轉診2800餘人。當發生大量傷病患意外事件時，則立即協助消防署及國家搜救指揮中心判斷病情嚴重性及空中緊急救護之必要性，同時與地面EOC協調合作，此次阿里山火車事故發生時，立即發揮此項功能，將嚴重病患予以空中轉送，輕傷患者則由路面救護車轉送，並與接受醫院保持協調聯繫。
此次阿里山火車意外事故在衛生署、嘉義縣政府衛生局，內政部空中勤務總隊、警政署、消防署、國防部海鷗直升機部隊及民間救難團隊之共同合作下，立即展現陸空協力之緊急醫療救護作為，有效降低意外傷亡，衛生署署長邱文達表示，相當肯定與感謝各單位之通力合作。