行政院衛生署中央健康保險局應國內學術研究需求，在保障民眾隱私以及資料安全前提下，特委託財團法人國家衛生研究院建置與管理「全民健康保險研究資料庫」，提供健保資料加值服務。
目前國內醫藥衛生研究人員已廣泛運用該資料庫所提供之加值資料進行研究，服務申請量已達300件以上(如附圖1)，研究成果近3年發表於國際期刊達200篇(如附圖2)，其中具高影響力(影響係數大於3)期刊則有78篇(如附圖3)，顯見該資料庫有助於提高國內醫藥衛生實證研究成果之國際能見度。依使用者問卷調查結果，90%受訪者對資料庫整體服務感到滿意(如附圖4)。
為保護資料安全，資料庫之資料均經二次加密，確保個別資料無法辨識，並可鑑別資料申請者，以限制資料散佈。國內學術研究機構可至國家衛生研究院網站，下載申請書並附研究計畫後提出申請。詳細內容請參閱國衛院網站（網址: http://www.nhri.org.tw並請點選主選單中：研究資源項下研究資源網站項下之全民健康保險研究資料庫)。