食品藥物管理署執行市售食品中真菌毒素含量監測計畫(包括總黃麴毒素、黃麴毒素M1、赭麴毒素A、橘黴素、棒麴毒素)，其中，101年至103年5月抽驗烘焙咖啡豆、咖啡粉共計82件，檢驗赭麴毒素A，均符合規定；其中烘焙咖啡豆44件，均未檢出赭麴毒素A，另於38件咖啡粉中有6件(15.8%)檢出赭麴毒素A，檢出濃度範圍為0.7-2.1 ppb，平均檢出濃度為1.28 ppb，均符合我國「食品中真菌毒素限量標準(5 ppb)」之規定。
我國現行標準係經參考國內咖啡產品之含量背景值、國人攝食暴露量等風險評估結果，據以研訂，已充分考量國人於正常飲用咖啡之情形下，不致因攝取過多赭麴毒素而導致健康危害，且該標準亦與歐盟一致。
赭麴毒素A為黴菌所產生的一種真菌毒素，過去在咖啡豆中發現之污染案例，均是因為咖啡豆在收穫、採收及儲存環境之乾燥過程和環境溫濕度不當之情形下，導致黴菌生長產生赭麴毒素，因此，食藥署每年度均執行後市場監測計畫加強管理。食藥署特別提醒民眾，為維持咖啡豆之品質及衛生安全，應注意儲存環境之溫度及溼度，已經烘焙及研磨之咖啡粉末，因更易吸濕導致發霉，故應儘快用畢，才能享受香醇又維護健康!