健保局對於各類癌症病人並未有差別待遇，任何新藥廠商若能提供明確的療效及財務影響資料，健保局都會儘速邀請臨床醫藥專家會議進行審查，對於確有相對療效實證及成本效益的藥品，均會納入健保給付，以減少病患及家屬的財務負擔。
全民健康保險癌症用藥的費用支出，每年已超過117億元，若以99年乳癌病患計算，人數約7萬8千餘人，藥費約為37億餘元，每年人數成長約9%，藥費成長約10%。
有關外界關切治療乳癌第二線的口服標靶藥物「泰嘉錠」藥品健保目前尚未納入給付乙事，健保局先前已將廠商提出之申請資料，多次提臨床醫藥專家會議討論，惟廠商所提供之資料，對於能延長病人多久的壽命並沒有明確證據。另廠商對於健保財務影響之估算亦不正確。健保局已請廠商於有更明確之文獻報告，證明用「泰嘉錠」可改善整體存活期或相對療效後，再重新提出申請。廠商所提資料，健保局將再提會討論。
二代健保法規定，新藥是否納入健保給付，必要時須作醫療科技評估（HTA），健保局希望能爭取經費成立獨立的醫療科技評估研究組織或中心，針對新藥與現有治療藥物，評估多延長一段時間的壽命所需的費用是否為大眾所接受（即「成本效益」），該評估結果將會公開，供大眾審視。