自本（104）年7月登革熱疫情開始延燒，指定本部臺南醫院為登革熱應變醫院，該院7月至9月份急性病床佔床率從平均約70％提高至97％，急診每日就診人次是平時2倍，因應登革熱病人數逐漸增加，全院累計收治登革熱人數346人，截至今日（9月23日）登革熱尚住院101人，急診待床7位，已陸續進行床位調整，除調借外科病床、增加內科專科病床，並協調安寧病床收治，以全力解決急診病人待床情況。
該院秉持公醫使命，挹注人力、物力，動員醫院全體同仁，積極配合國家衛生防疫要求因應作為：
（一）在病人治療與病情監控方面：醫院內部同仁分工合作，醫師依病人病症治療，必要時由感染科醫師與重症醫師通力合作；感染科追蹤快篩報告與本部疾病管制署報告，護理科則每日追蹤記錄每位病人性別、年齡，過去病史與血小板數值變化，做適時通報，以監控並協助有效掌握病情變化與治療。
（二）提供人員關懷方面：李伯璋院長體恤第一線人員辛苦，提供急診工作人員午餐及晚餐便當、提供院外支援人員舒適乾淨的住宿；積極招募日薪白班護理人力以減輕護理負荷。此外，研議護理人員夜班費的調升，以實質獎勵護理人員的付出。
（三）病床調度與護理人力調派方面：護理科每日與醫政室共同進行床位調整後，又立即進行專科護理師業務與護理人力調派，包含護理科、衛教室、品質中心等護理師的整併支援，惟護理人力仍然緊繃。
該院為提供市民優質醫療服務，非緊急醫療需要之病人，經醫師向病人詳予說明及解釋後，再依病人需求安排轉診至鄰近醫院，以方便全院醫療同仁全力投入登革熱病患治療。
本部附屬醫療及社會福利機構管理會林慶豐執行長銜命於9月22日親自南下，現場指導臺南醫院收治登革熱病患及協調護理人力不足情形，並指示全力動員本部所屬醫院，經緊急調度其他25家醫院，自9月21日起至10月21日支援臺南醫院護理人力，先期投入支援人力385名，平均每日支援12名護理人力，期以所屬醫院情誼相挺臺南醫院，共同打擊登革熱疫情，達成國家衛生防疫目標。